Se realizó un estudio observacional descriptivo, retrospectivo de corte transversal sobre el comportamiento de la sepsis intrahospitalaria en el servicio de NeonatologÃa, en el perÃodo comprendido desde enero del 2007 hasta diciembre del 2009. El universo de estudio estuvo conformado por 620 muestras biológicas procedentes de los pacientes atendidos en el servicio que adquirieron sepsis intrahospitalaria, mientras que la muestra quedó conformada por 452 para un (72,9 %) de aislamientos microbiológicos obtenidos en estos pacientes. El Estafilococo coagulasa negativo y Escherichia coli resultaron los de mayor frecuencia de aislamiento seguido de Estafilococo aureus y Acinetobacter Se determinaron los patrones de resistencia de los aislamientos y se compararon los 3 años. En el caso de Estafilococo aureus se encontraron altos niveles de resistencia a penicilina y ampicillina además de cifras de cepas resistentes a la vancomicina. Niveles elevados de resistencia a diferentes antimicrobianos presentaron también las cepas de Estafilococo coagulasa negativa. Se reportaron cepas resistentes a antimicrobianos de muy escaso uso en el hospital, como augmentin y aztreonam. La mayor cantidad de muestras estudiadas fueron procedentes de tubos endotraqueales (153) catéter (122) cultivos (52) .Se comparan los patrones de resistencia con otros servicios. Se realizan conclusiones y recomendaciones.